Az Európai Unió és Svájc 2006. február 27-én kétoldalú megállapodás kötött, amelynek értelmében Svájc a tíz, 2004-ben csatlakozott ország részére öt éven át összesen 1 milliárd svájci frank értékben fejlesztési hozzájárulást biztosít. Ebből Magyarország részesedése bruttó 130.738.000 svájci frank - vagyis 19,7 milliárd forint. Az együttműködési program célja egyrészt az Európai Unió tagállamai közötti, másrészt az érintett országok belső viszonyaiban tapasztalható egyenlőtlenségek csökkentése. Magyarországon az első pályázati kiírások megjelenése 2008 nyarán várható. Az utolsó kifizetés határideje pedig 2017. június 14. A most aláírt dokumentum előkészítéséért magyar részről a Nemzeti Fejlesztési Ügynökség felelt. Az érintett szaktárcák és a civil szféra képviselőinek bevonásával zajló tárgyalássorozat, amely a program Magyarországon követendő prioritásait és a rendelkezésre álló források felhasználásának kereteit határozta meg, ez év szeptemberében ért véget. Az itt született megállapodás végleges szövegét a Svájci Államtanács és a magyar kormány is jóváhagyta, így lehetővé válik az abban foglaltak végrehajtása. Bajnai Gordon önkormányzati és területfejlesztési miniszter kiemelte: a Svájci Alap forrásainak minimum 40 százalékát a leghátrányosabb helyzetben lévő, észak-magyarországi és észak-alföldi régiókra fordítják. A svájci fél elvárásainak megfelelően a források felhasználásakor a tartalmi és földrajzi koncentráció elvét kell követni. A rendelkezésre álló pénz 70%-át 8 prioritási területen kell lekötni, illetve, a támogatás 40%-át az Észak Alföld és az Észak Magyarország régiókban kell felhasználni. A program indításának első két évében a forrásoknak maximum 80%-ára vállalhatunk kötelezettséget. A fennmaradó 20% sorsáról a második év végi értékelés alapján születhet döntés. A Svájci-Magyar Együttműködési Program Stratégiai Keretszabályozásának részletes dokumentumát a Nemzeti Fejlesztési Ügynökség honlapján, a www.nfu.hu oldalon teszik közzé.