Teljesen megújul az épület, valamint a denevérek titokzatos életét, táplálkozását, vándorlását bemutató kiállítás. A projekt az Interreg V-A Hungary-Croatia Co-operation Programme 2014-2020 „Green Baranya / Baranja” pályázat segítségével valósul meg. 2019. március 1-től - a kivitelezési munkálatok időtartama alatt - a múzeum zárva tart, előreláthatólag késő őszig. A pályázat részeként ezen kívül megvalósul a Jakab-hegyi pálos kolostor romjainak állagmegóvása; a szaporcai Ős-Dráva Látogatóközpontban pedig a kerékpáros- és vízi turizmushoz köthető infrastruktúrát fejleszti az igazgatóság.